More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2295 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 88 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0033  chaperonin Cpn10  65.52 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1595  Chaperonin Cpn10  52.94 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000279872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2138  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.580367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1322  chaperonin Cpn10  57.5 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.071778  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02000  Chaperonin GroES (HSP10)  55.91 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0662925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 		 104 aa  97.1  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  54.02 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  54.02 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000377642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  52.17 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  52.17 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  48.96 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1345  chaperonin Cpn10  57.5 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.234338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  51.09 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  52.87 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  55.68 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0309  co-chaperonin GroES  57.47 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0556646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  46.94 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 95 aa  93.6  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  52.81 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 95 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  50.56 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0632  co-chaperonin GroES  49.43 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  52.17 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  50.56 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  47.87 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  50.56 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  52.27 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  51.65 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  51.09 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0567  co-chaperonin GroES  51.14 
 
 		 87 aa  91.3  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000722404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  50.53 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  44.79 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 99 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2230  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  54.55 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>