150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2262 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 324 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  94.03 
 
 		 323 aa  541  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  35.35 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  35.35 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  44.44 
 
 		 178 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.68 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  46.27 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  44.03 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  46.38 
 
 		 175 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  40.54 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  41.3 
 
 		 237 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  41.78 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  35.53 
 
 		 183 aa  92.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  47.79 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  42.18 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  33.54 
 
 		 183 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  34.09 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  34.67 
 
 		 183 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  36 
 
 		 214 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  38.41 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  34.67 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  34.67 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  36.75 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  36.75 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  36.75 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  35.63 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  42.11 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  36.31 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.63 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  42.96 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.43 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.43 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  29.8 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  37.65 
 
 		 192 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  34.32 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.85 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  38.46 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  38.46 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  38.46 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  38.46 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  36.59 
 
 		 191 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  41.94 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  37.82 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  34.51 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  35.62 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  39.6 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  35.97 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  43.88 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  36.76 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  39.13 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  48.19 
 
 		 382 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  37.23 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.12 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.42 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.18 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  35.17 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.03 
 
 		 167 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  33.33 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  30.66 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.83 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  37.61 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  31.21 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  31.58 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.71 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.08 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.19 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4895  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.65 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.51 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.78 
 
 		 117 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  32.35 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  32.35 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.17 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  35.97 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  36.89 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  29.5 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  34.25 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  31.91 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  27.08 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  33.73 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  29.24 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.46 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  28.77 
 
 		 166 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  28.35 
 
 		 183 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.22 
 
 		 163 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  28.29 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  29.1 
 
 		 174 aa  54.3  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  26.09 
 
 		 192 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  35.66 
 
 		 255 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  34.03 
 
 		 224 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  33.67 
 
 		 183 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>