More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2258 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  46.31 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  48.12 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  47.52 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  42.72 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  48.58 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  44.84 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  36.86 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  42.21 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  40.55 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.84 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.15 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  36.3 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  36.08 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  38.01 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  38.78 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  39.18 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  42.33 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  36.77 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  36.52 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  39.59 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  37.97 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  37.88 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  36.86 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  36.27 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  36.27 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  36.27 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  37.59 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  36.75 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.91 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  37.55 
 
 		 390 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.96 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.96 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  37.96 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  37.96 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.96 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 304 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  32.04 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  31.4 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  39.26 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  35.4 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  35.89 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  34.81 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  33.89 
 
 		 313 aa  168  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 289 aa  168  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  36.59 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  35.25 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  35.94 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  36.68 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  36.52 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  35.96 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  34.84 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  38.95 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  35.64 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  37.15 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  34.88 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  35.74 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  36.24 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  35.64 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  35.66 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  37.77 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>