More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2179 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  45.86 
 
 		 857 aa  731    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  45.86 
 
 		 857 aa  731    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  51.35 
 
 		 870 aa  829    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  55.83 
 
 		 824 aa  895    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  52.52 
 
 		 812 aa  836    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  48.23 
 
 		 865 aa  767    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  48 
 
 		 940 aa  743    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2036  AAA family ATPase  44.89 
 
 		 832 aa  725    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.23 
 
 		 859 aa  746    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  58.04 
 
 		 817 aa  979    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  58.96 
 
 		 811 aa  971    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  47.28 
 
 		 874 aa  755    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  46.17 
 
 		 857 aa  730    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  58.96 
 
 		 811 aa  971    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  58.96 
 
 		 811 aa  971    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  58.96 
 
 		 811 aa  971    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  45.64 
 
 		 858 aa  738    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  45.64 
 
 		 858 aa  739    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  46.81 
 
 		 865 aa  749    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  62.68 
 
 		 830 aa  1041    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  57.64 
 
 		 855 aa  963    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  47.06 
 
 		 891 aa  759    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  48.28 
 
 		 873 aa  785    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  60.54 
 
 		 823 aa  976    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  46.1 
 
 		 872 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  55.68 
 
 		 814 aa  907    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  49.76 
 
 		 847 aa  795    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  45.5 
 
 		 862 aa  730    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  59.25 
 
 		 843 aa  959    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1484  ATPase  47.15 
 
 		 863 aa  743    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  47.25 
 
 		 862 aa  734    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  58.6 
 
 		 846 aa  963    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  49.57 
 
 		 949 aa  750    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  58.96 
 
 		 811 aa  971    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  58.64 
 
 		 842 aa  983    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  60.2 
 
 		 824 aa  959    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  48.79 
 
 		 883 aa  779    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  58.41 
 
 		 840 aa  908    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  49.54 
 
 		 870 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  65.13 
 
 		 834 aa  1052    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  47.74 
 
 		 879 aa  760    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  46.54 
 
 		 859 aa  746    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0119  ClpB protein  43.89 
 
 		 854 aa  726    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  46.76 
 
 		 871 aa  729    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  48.09 
 
 		 879 aa  750    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  49.57 
 
 		 949 aa  754    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  47.69 
 
 		 879 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  45.95 
 
 		 878 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  46.81 
 
 		 865 aa  749    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  49.64 
 
 		 818 aa  787    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  47.05 
 
 		 862 aa  746    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  46.44 
 
 		 859 aa  732    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  61.69 
 
 		 847 aa  1016    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  53.73 
 
 		 837 aa  793    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  52.67 
 
 		 886 aa  768    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  100 
 
 		 834 aa  1664    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  47.98 
 
 		 891 aa  763    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 848 aa  802    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  52.28 
 
 		 814 aa  840    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  52.4 
 
 		 814 aa  839    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  46.77 
 
 		 856 aa  729    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  59.69 
 
 		 825 aa  972    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  56.23 
 
 		 825 aa  925    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  46.05 
 
 		 857 aa  727    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  46.05 
 
 		 857 aa  727    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  47.35 
 
 		 864 aa  731    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  57.95 
 
 		 828 aa  931    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  45.65 
 
 		 868 aa  731    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  47.96 
 
 		 850 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  50 
 
 		 823 aa  830    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  48.58 
 
 		 838 aa  788    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  50.06 
 
 		 826 aa  801    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  62.44 
 
 		 830 aa  1024    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0147  ATPase  47.47 
 
 		 861 aa  725    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.919618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  46.05 
 
 		 857 aa  727    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  64.36 
 
 		 839 aa  1066    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  46.47 
 
 		 864 aa  725    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  49.45 
 
 		 854 aa  798    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  46.78 
 
 		 875 aa  742    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  63.52 
 
 		 861 aa  1028    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  61.69 
 
 		 847 aa  1016    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  46.01 
 
 		 848 aa  729    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  61.25 
 
 		 847 aa  1037    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  48.65 
 
 		 949 aa  758    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  46.56 
 
 		 867 aa  735    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2232  ATPase  46.66 
 
 		 870 aa  734    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  58.4 
 
 		 842 aa  978    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  58.64 
 
 		 843 aa  977    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  57.64 
 
 		 855 aa  965    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  58.01 
 
 		 859 aa  963    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  45.71 
 
 		 863 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  59.39 
 
 		 818 aa  965    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  61.81 
 
 		 847 aa  1029    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  58.35 
 
 		 841 aa  976    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  61.14 
 
 		 812 aa  988    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  60.84 
 
 		 847 aa  1020    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  57.86 
 
 		 840 aa  902    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  53.1 
 
 		 848 aa  732    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  62.23 
 
 		 844 aa  1021    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1024  ATPase  45.82 
 
 		 857 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>