More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2166 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 145 aa  288  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 141 aa  196  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 140 aa  193  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  66.67 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  63.77 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  61.15 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  63.5 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 144 aa  183  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  182  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  57.97 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 143 aa  180  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 144 aa  180  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 146 aa  180  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 140 aa  179  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  60 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  57.25 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  56.52 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  64.49 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  56.52 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  62.32 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  63.31 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  175  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>