More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2150 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 127 aa  253  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  64.71 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  59.05 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  62.75 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  54.72 
 
 		 110 aa  123  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  62.75 
 
 		 113 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  58.33 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  59.8 
 
 		 114 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  58.82 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  56.86 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  59.05 
 
 		 212 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  61.76 
 
 		 113 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  60.78 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  57.84 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  56.73 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  59.8 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  58.82 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  56.48 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  58.1 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  58.82 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  58.82 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  54.9 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  58.82 
 
 		 159 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  59.05 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  54.29 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  58.1 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  52.54 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  55.34 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  58.1 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  59.05 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  59.8 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  55.88 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  53.85 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  57.43 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  56.19 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  57.43 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1849  50S ribosomal protein L22  54.46 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000192046  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0342  50S ribosomal protein L22  54.46 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000162922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1569  ribosomal protein L22  52.29 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00016664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  56.86 
 
 		 117 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  53.92 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  53.92 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  51.96 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  56.44 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  53.85 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  52.38 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  50.96 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  53.85 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  48.54 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  50.49 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  56.19 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  47.62 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  50.47 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  58.16 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  52.38 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  54.29 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  50.47 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  54.9 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  53.47 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  55.88 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  54.9 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  53.4 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  50.49 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  56.25 
 
 		 110 aa  103  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>