More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2135 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  100 
 
 		 428 aa  843    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  51.16 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  50.93 
 
 		 420 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  51.05 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  49.3 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  48.76 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 		 421 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  48.53 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.5 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 435 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  48.85 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  49.31 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  46.19 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  47.13 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  48.17 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  46.99 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  46.08 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  47.19 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  49.3 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  49.3 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  47.19 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  47.84 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  45.89 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  47.59 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  46.44 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  46.12 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  46.95 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  46.35 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  47.43 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  47.43 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  47.43 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  48.25 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  46.54 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  47.43 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  45.66 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  46.21 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  45.39 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  45.62 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  47.37 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  46.39 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  45.31 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  49.3 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  47.83 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  47.13 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  48.44 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  48.49 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  47.47 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  47.71 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  46.5 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  45.66 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  46.45 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  49.43 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  46.53 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  46.77 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  47.38 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  46.24 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  46.92 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.9 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  44.87 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  46.01 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  44.68 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  44.68 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  47.02 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  47.8 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  46.1 
 
 		 446 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  46.1 
 
 		 446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  45.63 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  46.44 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.47 
 
 		 439 aa  359  6e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  47.37 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  44.63 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.41 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  44.95 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  46.34 
 
 		 446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  44.86 
 
 		 441 aa  356  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.86 
 
 		 446 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  43.81 
 
 		 500 aa  355  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  45.73 
 
 		 437 aa  355  7.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  44.44 
 
 		 449 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  45.55 
 
 		 457 aa  354  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  45.39 
 
 		 443 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  44.9 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  43.87 
 
 		 442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.72 
 
 		 463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  44.31 
 
 		 444 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  44.31 
 
 		 444 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  44.55 
 
 		 440 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  45.15 
 
 		 443 aa  352  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  45.11 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  43.75 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  44.18 
 
 		 442 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  45.12 
 
 		 426 aa  349  5e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 		 442 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  44.81 
 
 		 448 aa  348  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 		 442 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.35 
 
 		 419 aa  348  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  44.31 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  45.15 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>