More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2130 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2130  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.012863  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  65.04 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  61.48 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 		 129 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 130 aa  166  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  66.4 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  66.4 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  61.48 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  58.21 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  62.3 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  62.3 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  63.33 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  56.35 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  56.35 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  64.12 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  56.35 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  56 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  60.98 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  63.48 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  60.98 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  59.35 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  65.83 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  50 
 
 		 135 aa  160  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  62.61 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  63.36 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  63.2 
 
 		 139 aa  157  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  54.33 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 137 aa  156  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  57.5 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  61.4 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 134 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  59.02 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  64.04 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  52.85 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  61.74 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  53.28 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  61.9 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  55.91 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  55.91 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  62.4 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  54.92 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  64 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  65.83 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  53.28 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  60.87 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  67.21 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  53.28 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  60.87 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  53.28 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  154  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  65.83 
 
 		 135 aa  153  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  52.03 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>