More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2125 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2125  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0679248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  54.13 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  45.92 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.31 
 
 		 286 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  43.58 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  45.06 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  45.06 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.64 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.36 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  48.75 
 
 		 344 aa  207  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1418  ABC transporter related  40.46 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1152  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00740539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  48.74 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.52 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  36.6 
 
 		 280 aa  205  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.52 
 
 		 285 aa  204  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1802  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.72 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.135758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  44.16 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.21 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  43.6 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  48.26 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  44.36 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  45.31 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  49.12 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0226  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.78 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.18 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.69 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  43.91 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.69 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.64 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.23 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.1 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0153  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.64 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1113499999999999e-42 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  44.44 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 249 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  41.7 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2248  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.77 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2289  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.77 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000430525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 291 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000352159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  36.96 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1087  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.52 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  41.74 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  42.52 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.47 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 395 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.42 
 
 		 411 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.02 
 
 		 293 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.22 
 
 		 398 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.61 
 
 		 403 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.96 
 
 		 541 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  45.3 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl153  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.52 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  38.6 
 
 		 574 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.61 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 402 aa  178  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 456 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  42.64 
 
 		 574 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  41.63 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  40.76 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.61 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  38.89 
 
 		 273 aa  175  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  38.89 
 
 		 273 aa  175  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  41.51 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0702  ABC transporter related  41.96 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.42 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  38.16 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.99 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.36 
 
 		 440 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  42.61 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  35.25 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  43.53 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.13 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>