More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2063 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  72.68 
 
 		 425 aa  658    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  72.45 
 
 		 425 aa  658    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  72.45 
 
 		 425 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  72.21 
 
 		 425 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  72.45 
 
 		 425 aa  657    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  71.29 
 
 		 430 aa  634    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  76.01 
 
 		 428 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  72.45 
 
 		 425 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  72.45 
 
 		 425 aa  658    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  73.71 
 
 		 428 aa  668    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  71.5 
 
 		 425 aa  652    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  74.1 
 
 		 427 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2063  isocitrate lyase  100 
 
 		 426 aa  879    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  72.45 
 
 		 425 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  72.21 
 
 		 425 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0040  isocitrate lyase  76.42 
 
 		 426 aa  682    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  72.45 
 
 		 425 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4164  isocitrate lyase  69.41 
 
 		 428 aa  631  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.652432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  74.02 
 
 		 1110 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  71.19 
 
 		 428 aa  624  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  72.79 
 
 		 1111 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  71.63 
 
 		 443 aa  626  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  71.02 
 
 		 422 aa  627  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  73.04 
 
 		 1111 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  68.94 
 
 		 428 aa  623  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1009  isocitrate lyase  70.62 
 
 		 429 aa  621  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  72.95 
 
 		 1111 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  70.02 
 
 		 433 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  69.98 
 
 		 429 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  67.53 
 
 		 431 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  68.85 
 
 		 434 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  69.74 
 
 		 431 aa  608  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  67.45 
 
 		 431 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  70.1 
 
 		 492 aa  604  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  69.45 
 
 		 443 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  71.22 
 
 		 461 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  68.66 
 
 		 429 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4706  isocitrate lyase  67.78 
 
 		 438 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  70.46 
 
 		 435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1295  isocitrate lyase  68.5 
 
 		 434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0485225  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1232  isocitrate lyase  68.5 
 
 		 434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635123  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  69.98 
 
 		 435 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  69.73 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  69.73 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  69.73 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  69.73 
 
 		 475 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  69.73 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  69.73 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  71.15 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  69.38 
 
 		 435 aa  597  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  69.98 
 
 		 435 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  69.73 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  69.73 
 
 		 475 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  70.46 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  69.73 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  70.46 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2006  isocitrate lyase  69.12 
 
 		 422 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0308  isocitrate lyase  70.24 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0698  isocitrate lyase  70.98 
 
 		 435 aa  597  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0311  isocitrate lyase  69.49 
 
 		 429 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.251887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1558  isocitrate lyase  70.07 
 
 		 429 aa  591  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3449  putative isocitrate lyase  69.3 
 
 		 430 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0890897  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  68.52 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  68.52 
 
 		 434 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0405  isocitrate lyase  69.01 
 
 		 429 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156057 
 
 
-
 
NC_004310  BR1614  isocitrate lyase  69.59 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.642543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  67.46 
 
 		 432 aa  586  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3930  isocitrate lyase  69.27 
 
 		 429 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  66.43 
 
 		 432 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0999  isocitrate lyase  66.82 
 
 		 440 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0373  isocitrate lyase  68.37 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432855  hitchhiker  0.00124435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0816  isocitrate lyase  68.05 
 
 		 429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.745785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6438  isocitrate lyase  65.96 
 
 		 443 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4509  isocitrate lyase  64.1 
 
 		 434 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0219  isocitrate lyase  63.17 
 
 		 434 aa  574  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0895016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03887  isocitrate lyase  63.87 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3982  isocitrate lyase  63.87 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03847  hypothetical protein  63.87 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4430  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4469  isocitrate lyase  63.87 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0668028  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2985  isocitrate lyase  68.22 
 
 		 435 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.54257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4517  isocitrate lyase  64.1 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4015  isocitrate lyase  63.87 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.857815  normal  0.048313 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  63.66 
 
 		 432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4557  isocitrate lyase  63.87 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5485  isocitrate lyase  64.1 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4520  isocitrate lyase  64.1 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4249  isocitrate lyase  63.87 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4593  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 434 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4395  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 434 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3778  isocitrate lyase  65.27 
 
 		 435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10474  isocitrate lyase icl  66.51 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3957  isocitrate lyase  65.03 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0451  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 436 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0366  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0073  isocitrate lyase  65.88 
 
 		 452 aa  568  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0629  isocitrate lyase  66.75 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1097  isocitrate lyase  67.24 
 
 		 435 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0636  isocitrate lyase  66.75 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0649  isocitrate lyase  66.75 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.966467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>