More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1963 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  100 
 
 
254 aa  495  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  46.82 
 
 
250 aa  192  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  36.89 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  40.65 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  38.68 
 
 
238 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  45.45 
 
 
233 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  43.64 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  44.2 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  46.15 
 
 
236 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  45.12 
 
 
236 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  38.78 
 
 
245 aa  169  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  43.5 
 
 
231 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  48.6 
 
 
236 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  46.32 
 
 
236 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  37.85 
 
 
312 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  37.76 
 
 
241 aa  166  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  39.68 
 
 
237 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  44.44 
 
 
248 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  42.75 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  41.95 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  39.92 
 
 
251 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  33.06 
 
 
238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  36.95 
 
 
242 aa  165  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  43.12 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  43.12 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  41.22 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  39.76 
 
 
240 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  35.32 
 
 
241 aa  161  8.000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  42.21 
 
 
242 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  41.22 
 
 
251 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  39.68 
 
 
242 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  43.03 
 
 
237 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  38.28 
 
 
255 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  39.62 
 
 
238 aa  159  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  43.61 
 
 
240 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  43.61 
 
 
240 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  38.25 
 
 
244 aa  158  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  41.53 
 
 
229 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  46.67 
 
 
252 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  46.18 
 
 
238 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  39.83 
 
 
231 aa  155  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.4 
 
 
279 aa  154  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  40.16 
 
 
602 aa  155  9e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  40.76 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  38.58 
 
 
256 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  39.35 
 
 
268 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  42.51 
 
 
247 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  33.88 
 
 
237 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  40.96 
 
 
250 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  40.15 
 
 
256 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  38.49 
 
 
252 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  37.6 
 
 
227 aa  148  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  41.63 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  41.41 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  40.77 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  39.11 
 
 
245 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  39.83 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  41.01 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  41.45 
 
 
238 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  36.8 
 
 
239 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  42.56 
 
 
243 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  39.55 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  37.11 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  46 
 
 
260 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  39.18 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  36.72 
 
 
250 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  39.08 
 
 
241 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  44.31 
 
 
313 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  40.93 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  37.95 
 
 
259 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  37.67 
 
 
238 aa  135  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  36.45 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  40.34 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  34.36 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  40.09 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  43.83 
 
 
259 aa  132  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  38.12 
 
 
269 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  34.93 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  36.04 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  39.64 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  39.64 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  36.04 
 
 
269 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  39.19 
 
 
268 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  35.71 
 
 
313 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  36.89 
 
 
253 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  39.38 
 
 
256 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  35.11 
 
 
275 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  33.98 
 
 
254 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  35.87 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  37.4 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  37.5 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  35.69 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  39.19 
 
 
268 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  38.24 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  40.74 
 
 
233 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  38.74 
 
 
268 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  38.84 
 
 
305 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  38.84 
 
 
305 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  37.33 
 
 
254 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  39.66 
 
 
262 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>