173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1894 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  59.75 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  36.21 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  32.64 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  35.92 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  36.04 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  28.17 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  28.17 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  34.66 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  27.78 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  27.78 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  27.38 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  26.98 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  26.98 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.19 
 
 		 266 aa  85.1  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  30.85 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  28.17 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  25.68 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  30 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.34 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.03 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3415  ABC transporter permease  32.04 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  26.97 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  29.28 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3310  ABC transporter permease  32.04 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3313  ABC transporter permease protein  31.15 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.27 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3246  ABC transporter permease  32.04 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.82 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.12 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3235  ABC transporter permease protein  31.49 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  26.78 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  26.78 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  26.29 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  34.07 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.03 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  28.42 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.79 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  32.68 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  28.9 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  28.63 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.54 
 
 		 810 aa  70.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  38.24 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  30.53 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  27.93 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  27.93 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  27.7 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  27.57 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  28.29 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1046  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  28.67 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  27.76 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  28.29 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  28.29 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  28.29 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  28.29 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  26.42 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  28.29 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.98 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  27.19 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  28.29 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3067  hypothetical protein  28.42 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  26.22 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3355  hypothetical protein  28.76 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.587862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3260  hypothetical protein  28.76 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  27.89 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4227  hypothetical protein  28.42 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  29.18 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  32.35 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  35.51 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.93 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  35.51 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  32.17 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25.54 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.72 
 
 		 770 aa  63.5  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  32.14 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25.56 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  28.85 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  26.71 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  26.58 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  28.83 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  25.23 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  32.52 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.27 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  26.7 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  28.25 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  24.11 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  28.51 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  27.78 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.78 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.11 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  27.39 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>