More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1803 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
249 aa  491  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.19 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.31 
 
 
257 aa  202  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  40.65 
 
 
261 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
227 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0644  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.56 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000386152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
231 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.89 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.61 
 
 
239 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
257 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
241 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
231 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
231 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
233 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 
239 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
233 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
233 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 
230 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.89 
 
 
236 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 
226 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.08 
 
 
224 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  29.13 
 
 
232 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  28.64 
 
 
232 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
234 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  35.48 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.45 
 
 
227 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
227 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
236 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.11 
 
 
231 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  36.24 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.77 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1070  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105875  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.1 
 
 
226 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 
229 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
239 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0394  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.45 
 
 
237 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.56 
 
 
242 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
234 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  34.09 
 
 
225 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.57 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.29 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.72 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  33.33 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 
229 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.46 
 
 
225 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 
219 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
232 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
222 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
228 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
225 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.65 
 
 
225 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
227 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
234 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.57 
 
 
228 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.48 
 
 
227 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 
224 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  27.08 
 
 
230 aa  105  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
226 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2668  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
225 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0967754  hitchhiker  0.000000348595 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.29 
 
 
227 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  28.31 
 
 
250 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  30.41 
 
 
352 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  28.89 
 
 
240 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2812  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
243 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
254 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.15 
 
 
227 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.38 
 
 
225 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.49 
 
 
229 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  29.05 
 
 
221 aa  102  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
228 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.87 
 
 
226 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
218 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.39 
 
 
224 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 
225 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5204  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
261 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.26828 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.02 
 
 
226 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0837  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  30.88 
 
 
222 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 
227 aa  99.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
223 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  28.63 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
231 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.28 
 
 
225 aa  99  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
236 aa  99  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.75 
 
 
251 aa  98.6  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>