14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1769 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1769  alkylmercury lyase  100 
 
 
186 aa  368  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1768  alkylmercury lyase  60.85 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.628119  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2087  alkylmercury lyase  56.78 
 
 
133 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.302578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0137  alkylmercury lyase  30.59 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02948  alkylmercury lyase  35.77 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597593  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25630  alkylmercury lyase  31.54 
 
 
227 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0243  alkylmercury lyase  32.52 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3214  alkylmercury lyase  29.86 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00854121  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4512  alkylmercury lyase  31.75 
 
 
221 aa  52  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0148177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0319  alkylmercury lyase  32.81 
 
 
209 aa  48.5  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2330  alkylmercury lyase  25.6 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0726495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5374  Alkylmercury lyase  28.14 
 
 
216 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2647  Alkylmercury lyase  30.99 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2197  alkylmercury lyase  26.45 
 
 
317 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>