More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1729 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  100 
 
 
396 aa  803    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  51.05 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  49.74 
 
 
393 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  49.21 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  45.15 
 
 
394 aa  335  9e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  47.23 
 
 
409 aa  322  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  37.02 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  35.48 
 
 
390 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  36.39 
 
 
376 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  35.06 
 
 
376 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  35.84 
 
 
377 aa  236  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  35.05 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  35.4 
 
 
376 aa  234  3e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 
377 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 
388 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  37.66 
 
 
390 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  35.06 
 
 
385 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  33.95 
 
 
371 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  35.58 
 
 
377 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  35.48 
 
 
386 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  34.19 
 
 
376 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  36.34 
 
 
382 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  33.68 
 
 
371 aa  223  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  35.42 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 
377 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.29 
 
 
377 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  34.29 
 
 
377 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 
387 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  36.62 
 
 
387 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 
387 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  37.6 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  37.76 
 
 
386 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 
385 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  35.84 
 
 
371 aa  209  9e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  37.76 
 
 
369 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 
373 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  34.7 
 
 
419 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  38.73 
 
 
372 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  36.75 
 
 
367 aa  202  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 
380 aa  202  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  35.67 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  31.77 
 
 
371 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.99 
 
 
382 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  36.67 
 
 
395 aa  199  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  38.08 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  33.69 
 
 
372 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 
389 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 
369 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  37.11 
 
 
387 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  36.43 
 
 
388 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  34.18 
 
 
378 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 
389 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  31.35 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 
397 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  36.08 
 
 
386 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 
398 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
378 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  34.88 
 
 
413 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 
377 aa  173  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 
389 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 
397 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  32.55 
 
 
396 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
409 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
385 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 
403 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 
374 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  31.75 
 
 
409 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  31.7 
 
 
379 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 
418 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  35.64 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  35.86 
 
 
382 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
367 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  33.75 
 
 
392 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
378 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
384 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1260  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 
372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140047  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
374 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 
380 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
371 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.21 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
381 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 
381 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 
359 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 
366 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 
351 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
390 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>