More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1694 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  49.75 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  58.92 
 
 		 198 aa  195  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  49.49 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  51.5 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  49.5 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  47.78 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  47.67 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  45.69 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  44.22 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  44.22 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  44.22 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  43.15 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  43.22 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  46.91 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  43.68 
 
 		 215 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  40.98 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  42.72 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  39.35 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  41.97 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  40.4 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  39.22 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  40.1 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  39.9 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  41.38 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  38.27 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  39.34 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  35.61 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  37.44 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  30.43 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  43.3 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  28.87 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  31.91 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  43.3 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  42.27 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  29.69 
 
 		 284 aa  71.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  29.76 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.26 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  29.03 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  29.03 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  29.03 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  29.03 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  29.03 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  29.03 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  29.03 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  29.03 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  29.03 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  24.75 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  32.45 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  35.61 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  25.93 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>