71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1664 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 267 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  62.86 
 
 		 195 aa  171  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  56.16 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  58.16 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  55 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  53.85 
 
 		 218 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  50.34 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  39.04 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  45.65 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  33.85 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  33.85 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.58 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.77 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  36.36 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  36.42 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  34.31 
 
 		 556 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  33.57 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  32.85 
 
 		 521 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  42.55 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  26.16 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  36.81 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  32.28 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  38.17 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  27.6 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  31.34 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  29.93 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  30.56 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  29.57 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30.6 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  29.93 
 
 		 339 aa  53.1  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  35.58 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  33.09 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  29.34 
 
 		 316 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  27.91 
 
 		 384 aa  53.1  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  27.08 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  32.58 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  36.47 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  32.37 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.16 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  26.7 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  31.39 
 
 		 377 aa  52.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  26.7 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  29.93 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  32.26 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  30.77 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  28.26 
 
 		 377 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  32.64 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  31.62 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  33.93 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  28.57 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  28.76 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  25.99 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  30.3 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  24.87 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  26.26 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  31.03 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  37.23 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  26.52 
 
 		 395 aa  46.6  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  36.84 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  29.2 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  27.91 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  26.92 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  28.95 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.47 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  31.54 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.55 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  27.01 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  31.91 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  30.6 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  22.95 
 
 		 189 aa  42.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  35.92 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>