More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1611 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  100 
 
 
558 aa  1098    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  43.83 
 
 
590 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  42.55 
 
 
585 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  42.26 
 
 
588 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  43.5 
 
 
572 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  38.21 
 
 
571 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  42.26 
 
 
585 aa  369  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  43.35 
 
 
586 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  37.14 
 
 
574 aa  363  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  39.36 
 
 
578 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  40.4 
 
 
574 aa  352  8e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  39.66 
 
 
605 aa  346  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  43.79 
 
 
591 aa  346  6e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  42.31 
 
 
588 aa  342  8e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  38.04 
 
 
588 aa  336  7e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  38.17 
 
 
592 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  39.46 
 
 
583 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  41.9 
 
 
584 aa  318  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  34.04 
 
 
626 aa  316  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  33.9 
 
 
603 aa  306  9.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  32.09 
 
 
608 aa  304  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  33.85 
 
 
711 aa  300  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  35.97 
 
 
560 aa  299  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  34.36 
 
 
730 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  35.5 
 
 
582 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  35.54 
 
 
577 aa  281  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  34.85 
 
 
573 aa  281  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  35.27 
 
 
574 aa  280  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  31.16 
 
 
573 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  32.94 
 
 
584 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  33.66 
 
 
711 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  32.49 
 
 
703 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  37.32 
 
 
582 aa  269  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  35.23 
 
 
563 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  37.52 
 
 
590 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  35.35 
 
 
557 aa  266  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  37.9 
 
 
571 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  33.33 
 
 
569 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  33.71 
 
 
588 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  33.33 
 
 
569 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  33.64 
 
 
620 aa  263  6.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  33.46 
 
 
565 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  33.14 
 
 
568 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  34.54 
 
 
568 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  34.39 
 
 
583 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  34.15 
 
 
580 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  33.86 
 
 
575 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  34.54 
 
 
568 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  33.91 
 
 
571 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  34.09 
 
 
575 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  34.5 
 
 
586 aa  258  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  34.08 
 
 
581 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  31.36 
 
 
580 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  33.73 
 
 
579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.7 
 
 
584 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  32.28 
 
 
578 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  34.38 
 
 
576 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  31.58 
 
 
703 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  32.42 
 
 
603 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  31.85 
 
 
585 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  33.21 
 
 
597 aa  250  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  34.71 
 
 
592 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  33.99 
 
 
586 aa  250  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  34.77 
 
 
590 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  33 
 
 
573 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  32.46 
 
 
596 aa  248  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  32.24 
 
 
585 aa  246  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  32.85 
 
 
590 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  32.05 
 
 
585 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  32.24 
 
 
585 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  36.01 
 
 
566 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  34.77 
 
 
569 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  33.79 
 
 
556 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  32.9 
 
 
592 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  33.47 
 
 
522 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  36.33 
 
 
574 aa  240  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  31.47 
 
 
585 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  31.47 
 
 
585 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  31.47 
 
 
585 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  31.47 
 
 
585 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  32.58 
 
 
565 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  32.71 
 
 
570 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  31.66 
 
 
590 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  33.92 
 
 
573 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  34.28 
 
 
585 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  32.43 
 
 
592 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  33.6 
 
 
517 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  32.3 
 
 
575 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  35.34 
 
 
556 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  32.06 
 
 
570 aa  237  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  30.45 
 
 
567 aa  236  6e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  32.2 
 
 
570 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  30.29 
 
 
591 aa  236  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  31.88 
 
 
595 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  32.12 
 
 
579 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  32.12 
 
 
579 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  31.26 
 
 
599 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  33.01 
 
 
576 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  32.52 
 
 
570 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  31.69 
 
 
570 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>