More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1592 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  100 
 
 
377 aa  765  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  52.91 
 
 
379 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  51.72 
 
 
378 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  44.39 
 
 
390 aa  304  1e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  42.34 
 
 
363 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  42.02 
 
 
377 aa  259  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  40.3 
 
 
414 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  39.48 
 
 
400 aa  255  1e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  38.07 
 
 
392 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  38.6 
 
 
370 aa  229  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  38.02 
 
 
477 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  38.46 
 
 
374 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  38.46 
 
 
374 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  37 
 
 
391 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  42.9 
 
 
325 aa  222  1e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  39.88 
 
 
368 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  37.08 
 
 
381 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  42.47 
 
 
305 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  37.63 
 
 
387 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  38.6 
 
 
386 aa  215  9e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  36.86 
 
 
383 aa  214  2e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  37.05 
 
 
422 aa  213  3e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  35.36 
 
 
369 aa  214  3e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  36.52 
 
 
422 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  35.52 
 
 
431 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  33.61 
 
 
369 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  33.61 
 
 
369 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  36.34 
 
 
435 aa  207  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  34.44 
 
 
385 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  36.9 
 
 
370 aa  201  2e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  37.5 
 
 
402 aa  198  1e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  34.88 
 
 
426 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  33.88 
 
 
389 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  35.93 
 
 
371 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  33.94 
 
 
416 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  36.07 
 
 
383 aa  182  9e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  32.53 
 
 
388 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  31.46 
 
 
373 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  38.53 
 
 
378 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  35.25 
 
 
374 aa  175  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  35.33 
 
 
409 aa  175  1e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  34.47 
 
 
379 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  34.47 
 
 
379 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  37.33 
 
 
391 aa  169  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  33.24 
 
 
392 aa  167  3e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  34.63 
 
 
404 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  29.39 
 
 
503 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  32.75 
 
 
437 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  33.33 
 
 
416 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.9 
 
 
463 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  31.97 
 
 
406 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  34.49 
 
 
367 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  33.87 
 
 
357 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  31.81 
 
 
407 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  38.79 
 
 
471 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  38.79 
 
 
471 aa  148  2e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  29.05 
 
 
442 aa  147  4e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  29.7 
 
 
381 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  32.52 
 
 
391 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  29.66 
 
 
451 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  29.39 
 
 
381 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  31.73 
 
 
365 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  28.18 
 
 
413 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  33.33 
 
 
393 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  31.27 
 
 
403 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.25 
 
 
376 aa  135  1e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.43 
 
 
376 aa  135  1e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.43 
 
 
376 aa  135  1e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  31.58 
 
 
506 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.91844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  31.14 
 
 
656 aa  132  7e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  31.23 
 
 
507 aa  132  8e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  33.85 
 
 
487 aa  132  1e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.68 
 
 
376 aa  132  1e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  31.7 
 
 
397 aa  131  2e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  29.53 
 
 
443 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  30.67 
 
 
380 aa  130  4e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  29.72 
 
 
378 aa  129  1e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.03 
 
 
386 aa  128  2e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  28.5 
 
 
508 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  28.5 
 
 
508 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  30.71 
 
 
422 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  30.24 
 
 
370 aa  121  2e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  29.19 
 
 
494 aa  121  2e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  32.34 
 
 
373 aa  120  5e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  30.29 
 
 
385 aa  117  4e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  27.01 
 
 
388 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  29.06 
 
 
443 aa  114  4e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  25.34 
 
 
356 aa  113  4e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  28.14 
 
 
373 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  29.84 
 
 
387 aa  112  7e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  29.17 
 
 
376 aa  112  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  25.57 
 
 
409 aa  111  2e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  28.45 
 
 
399 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  29.26 
 
 
395 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.28 
 
 
393 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  30.61 
 
 
404 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.68 
 
 
353 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.45 
 
 
384 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  27.1 
 
 
451 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  27.08 
 
 
393 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>