39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1590 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1590  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 286 aa  557  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2191  sugar phosphate isomerases/epimerases  37.54 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6104  xylose isomerase domain-containing protein  35.09 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30200  Xylose isomerase-type TIM-barrel protein  35.97 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4909  xylose isomerase-like TIM barrel  35.74 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2603  xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.38 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0698398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3481  xylose isomerase domain-containing protein  37.65 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3122  xylose isomerase domain-containing protein  35.02 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2673  xylose isomerase domain-containing protein  39.84 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1216  xylose isomerase domain-containing protein  35.13 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2699  xylose isomerase domain-containing protein  37.05 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.254699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3240  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2346  xylose isomerase domain-containing protein  41.04 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2149  xylose isomerase domain-containing protein  32.97 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.398235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.31 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022666  normal  0.0930685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2843  xylose isomerase domain-containing protein  38.91 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02960  hypothetical protein  39.49 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2702  xylose isomerase domain-containing protein  33.7 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.964957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0410  xylose isomerase-like TIM barrel  37.26 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0783  xylose isomerase-like TIM barrel  34.51 
 
 		 268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1392  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.05 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.59 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5912  xylose isomerase domain-containing protein  38.65 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  decreased coverage  0.00155667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.53 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7150  xylose isomerase domain-containing protein  28.78 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3491  xylose isomerase domain-containing protein  32.08 
 
 		 263 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3684  xylose isomerase domain-containing protein  26.43 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414118  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3640  xylose isomerase domain-containing protein  37.82 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1496  xylose isomerase domain-containing protein  29.07 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0134  xylose isomerase domain-containing protein  29.77 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3304  xylose isomerase domain-containing protein  32.89 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3378  hypothetical protein  33.05 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000043969  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2254  xylose isomerase domain-containing protein  30.3 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0839  xylose isomerase domain-containing protein  27.17 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6806  xylose isomerase domain-containing protein  30.98 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.03 
 
 		 615 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3702  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.2 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.92 
 
 		 638 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5018  hydroxypyruvate isomerase  25.12 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>