More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1551 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 407 aa  788    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  40.24 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.45 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  40.3 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  40.27 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 402 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  42.48 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 401 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.84 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  32.73 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  42.17 
 
 		 393 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  32.68 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  39.11 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.71 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 508 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  41.23 
 
 		 442 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  37.67 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  40.53 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.32 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  37.24 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  39.39 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  39.53 
 
 		 380 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  35.53 
 
 		 422 aa  130  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  38.54 
 
 		 430 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  38.35 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.32 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  36.79 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  35.55 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  40.28 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  40.47 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  36.81 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.04 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  42.36 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  40.61 
 
 		 395 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  33.73 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  37.25 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.64 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  37.8 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  33.14 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  38.86 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  38.32 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  34.93 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  38.29 
 
 		 367 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  38.91 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.32 
 
 		 443 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.63 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 438 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  39.56 
 
 		 426 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  38.54 
 
 		 457 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.66 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  36.68 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.29 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 652 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 421 aa  119  7e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 496 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  31.17 
 
 		 597 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  38.53 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.44 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  33.22 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  38.5 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  39.23 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  37.5 
 
 		 529 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  35.9 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  38.3 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  40.49 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.7 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  36.82 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 1226 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 404 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.22 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  31.95 
 
 		 478 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33000  signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  35.94 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 1229 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.43 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>