More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1550 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
220 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.01 
 
 
225 aa  245  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.97 
 
 
214 aa  224  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  53.18 
 
 
223 aa  218  4e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.81 
 
 
216 aa  215  3e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  54.34 
 
 
222 aa  215  3e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.29 
 
 
217 aa  212  4e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
219 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.69 
 
 
217 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  48.08 
 
 
218 aa  200  2e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.73 
 
 
211 aa  197  8e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  48.11 
 
 
213 aa  197  1e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.11 
 
 
213 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
220 aa  195  4e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  44.24 
 
 
222 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 
216 aa  191  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  45.79 
 
 
220 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 
216 aa  187  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
216 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 
218 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  44.65 
 
 
222 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 
217 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.18 
 
 
231 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.64 
 
 
220 aa  185  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  47.89 
 
 
220 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 
216 aa  185  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.48978e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.98 
 
 
229 aa  184  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
254 aa  184  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 
224 aa  183  1e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
254 aa  183  2e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.33 
 
 
239 aa  183  2e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  46.08 
 
 
234 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  47.66 
 
 
209 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 
222 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 
221 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  2.10563e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.51 
 
 
226 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45.7 
 
 
226 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  45.05 
 
 
219 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
218 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
225 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
218 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 
213 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  46.61 
 
 
227 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 
215 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 
215 aa  178  5e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 
224 aa  178  6e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 
215 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 
215 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  43.19 
 
 
215 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  43.19 
 
 
215 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 
215 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 
212 aa  177  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 
250 aa  177  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.25 
 
 
239 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 
217 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.29 
 
 
234 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 
214 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 
224 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 
225 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.82 
 
 
223 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.01 
 
 
221 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
257 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 
215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.01 
 
 
228 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 
215 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44.25 
 
 
228 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.05 
 
 
234 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  43.52 
 
 
218 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  43.32 
 
 
234 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
237 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 
215 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 
225 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
219 aa  174  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  45.21 
 
 
230 aa  174  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 
219 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 
211 aa  174  1e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.71 
 
 
224 aa  173  1e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 
241 aa  173  1e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 
224 aa  174  1e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
238 aa  174  1e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  45.79 
 
 
221 aa  174  1e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  43.19 
 
 
220 aa  173  1e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.84 
 
 
226 aa  173  1e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 
225 aa  173  1e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 
224 aa  174  1e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
230 aa  173  2e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 
215 aa  173  2e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 
222 aa  173  2e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.5 
 
 
226 aa  173  2e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.98 
 
 
225 aa  173  2e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 
213 aa  173  2e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 
219 aa  173  2e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.91 
 
 
218 aa  172  3e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3055  response regulator receiver  42.25 
 
 
219 aa  172  3e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 
219 aa  172  3e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
212 aa  172  3e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.5 
 
 
232 aa  172  3e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 
222 aa  172  3e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 
211 aa  172  3e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  42.52 
 
 
213 aa  172  4e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>