More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1538 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  100 
 
 		 478 aa  922    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  43.59 
 
 		 429 aa  329  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  39.82 
 
 		 435 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  40.7 
 
 		 428 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  40.81 
 
 		 446 aa  302  9e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  37.12 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  39.91 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  40.14 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  40.37 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  38.28 
 
 		 428 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  40.09 
 
 		 425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  40.09 
 
 		 425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  40.33 
 
 		 425 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  37.15 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  40.09 
 
 		 425 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  40.09 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  40.09 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  40.09 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  40.09 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  40.09 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  35.7 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  37.88 
 
 		 488 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  35.51 
 
 		 438 aa  279  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  37.82 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  34.7 
 
 		 433 aa  276  6e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  38.23 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  36.74 
 
 		 428 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  35.96 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  34.93 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  34.93 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  38.11 
 
 		 435 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  35.96 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  38.52 
 
 		 483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  37.36 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  37.33 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  36.78 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  32.63 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  34.41 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  33.97 
 
 		 449 aa  239  9e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  36.43 
 
 		 507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  34.72 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  35.43 
 
 		 481 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  34.97 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  33.8 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  39.72 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.68 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  32.87 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  34.04 
 
 		 427 aa  227  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  32.87 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  36.24 
 
 		 478 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  36.24 
 
 		 478 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  36.24 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  34.32 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  33.41 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  35.65 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  30.82 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  34.68 
 
 		 435 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  35.03 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  32.86 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  34.12 
 
 		 451 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  33.8 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  35.28 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  34.88 
 
 		 473 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  34.6 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  34.03 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  33.56 
 
 		 479 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  34.03 
 
 		 466 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  32.63 
 
 		 481 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  32.02 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  35.15 
 
 		 500 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.67 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  34.81 
 
 		 471 aa  206  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  31.86 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  31.89 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  33.65 
 
 		 448 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  28.78 
 
 		 485 aa  203  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  31.87 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  30.9 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  31.4 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  32.94 
 
 		 465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  29.8 
 
 		 471 aa  199  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  29.93 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  32.47 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  31.24 
 
 		 491 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  32.25 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  28.82 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  28.82 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  31.34 
 
 		 437 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  28.54 
 
 		 460 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  31.07 
 
 		 466 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  32.48 
 
 		 459 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  31.37 
 
 		 474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  30.93 
 
 		 431 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  29.31 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  31.64 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  31.07 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  31.93 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  32.34 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  32.03 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  31.95 
 
 		 447 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>