More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1530 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  52.42 
 
 		 233 aa  231  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  50.9 
 
 		 227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  57.27 
 
 		 229 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  49.78 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  48.66 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  48.66 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 230 aa  208  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  49.1 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  49.55 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  48.64 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  48.64 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  49.09 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  49.09 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  49.09 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  49.09 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  48.64 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  48.64 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  46.4 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  44.86 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  48.68 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  43.61 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  45.05 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  48.25 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  44.14 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  44.3 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  44.3 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  47.53 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  45.37 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  48.44 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  51.12 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  45.95 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  46.85 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  44.64 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  45.33 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  40.87 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  44.84 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  47.26 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  46.73 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  44.75 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  43.64 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  44.69 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  45.16 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  44.54 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  44.54 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  44.83 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  40.38 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  43.11 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  41.78 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  38.33 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  41.47 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  42.53 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  45.58 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  43.5 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  41.43 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  42.79 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  39.07 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  42.79 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  41.52 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  41.44 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  38.71 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  42.79 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  43.42 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  43.3 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  43.89 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  39.44 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  50.31 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  36.61 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  35.5 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  42.59 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  39.21 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  36.77 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  46.02 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  39.07 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  37.22 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  42.79 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 222 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  37.39 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  39.53 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  38.26 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  43.18 
 
 		 185 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  37.96 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  37.96 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>