More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1525 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  100 
 
 		 95 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  51.52 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.92 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  41.41 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  42.86 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 104 aa  84.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  45.92 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  42 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  41 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43.88 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  39.39 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  41.41 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  41.84 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  46.39 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  45.45 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  37.37 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2041  50S ribosomal protein L21  47.42 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  43.88 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  39.39 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.57 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  40.4 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  42.27 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  37 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  45.92 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  45.92 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  38.95 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  40.21 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3891  50S ribosomal protein L21  43.3 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.428524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.56 
 
 		 230 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  40.21 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  38.46 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  37 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  39.18 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  39.18 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  39.18 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  39.18 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  38.78 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  37.11 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1601  50S ribosomal protein L21  36.46 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  40.82 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>