More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1524 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 86 aa  167  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  81.08 
 
 		 86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 86 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  74.07 
 
 		 99 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 87 aa  114  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 88 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  69.14 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  73.24 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  73.24 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  66.25 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  70 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 86 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 97 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  105  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  69.14 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  66.67 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  73.24 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  103  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>