250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1507 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  100 
 
 		 134 aa  263  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  48.15 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  49.21 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  52.89 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  46.03 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  45.08 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  48.82 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  46.03 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  45.53 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  47.62 
 
 		 127 aa  107  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  48.84 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  45.53 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  47.37 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  50 
 
 		 137 aa  105  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  46.67 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  43.2 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  48.76 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  42.31 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  48.76 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  52.5 
 
 		 138 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  48.76 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  49.18 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  47.2 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  42.19 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  44.54 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  44.27 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  46.28 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  47.97 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  44.35 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  47.5 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  50.42 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  43.55 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  49.59 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  49.17 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  46.92 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  44.27 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  46.77 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  45.08 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  48.28 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  44 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  48.67 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  48.28 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  42.62 
 
 		 128 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  43.85 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  49.54 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  47.9 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  47.11 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  42.4 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  41.01 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  39.84 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  44.8 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  48.78 
 
 		 199 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  48.33 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  49.55 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  44.17 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  44.96 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  45.97 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  45.13 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  46.28 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  41.46 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  41.67 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  48.67 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  47.06 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  46.03 
 
 		 234 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  46.77 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  44 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  49.06 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  49.58 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  43.38 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  36 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  46.72 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  48.45 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  48.28 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>