More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1470 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
412 aa  834    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  70.95 
 
 
395 aa  568  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  67.51 
 
 
397 aa  548  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  70.99 
 
 
393 aa  545  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  67.68 
 
 
396 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  67.43 
 
 
396 aa  546  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  68.19 
 
 
395 aa  544  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  68.19 
 
 
395 aa  544  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  67.68 
 
 
396 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 
395 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  67.43 
 
 
397 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
403 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  68.45 
 
 
402 aa  533  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 
405 aa  532  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  64.81 
 
 
396 aa  531  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  65.98 
 
 
396 aa  530  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  66.15 
 
 
402 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  66.33 
 
 
403 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  65.08 
 
 
399 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  65.08 
 
 
399 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 
408 aa  526  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  64.71 
 
 
395 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  65.08 
 
 
399 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
399 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
399 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
399 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
399 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 
395 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
399 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
399 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  65.08 
 
 
399 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  64.74 
 
 
396 aa  522  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
399 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  65.05 
 
 
391 aa  519  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
396 aa  518  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  65.22 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
405 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  63.29 
 
 
398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  67.59 
 
 
405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  63.29 
 
 
398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  65.39 
 
 
397 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  65.73 
 
 
397 aa  513  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  63.96 
 
 
396 aa  514  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  65.21 
 
 
391 aa  508  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  64.12 
 
 
397 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  64.81 
 
 
414 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  64.07 
 
 
401 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  63.36 
 
 
400 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  64.56 
 
 
395 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  65.08 
 
 
410 aa  498  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  65.14 
 
 
395 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  63.78 
 
 
403 aa  498  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 
391 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 
391 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  64.19 
 
 
399 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  63.8 
 
 
399 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  63.2 
 
 
398 aa  494  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  63.27 
 
 
397 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  61.28 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  61.81 
 
 
401 aa  492  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 
387 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  63.71 
 
 
398 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  64.08 
 
 
400 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
399 aa  491  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  64.05 
 
 
399 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  63.45 
 
 
398 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  59.24 
 
 
388 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  61.03 
 
 
403 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  63.8 
 
 
399 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  61.87 
 
 
421 aa  490  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 
403 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  62.05 
 
 
387 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 
403 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0501  S-adenosylmethionine synthetase  61.71 
 
 
420 aa  488  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  63.27 
 
 
399 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 
411 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  63.12 
 
 
400 aa  485  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 
407 aa  487  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  61.62 
 
 
397 aa  488  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  61.38 
 
 
402 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  62.66 
 
 
397 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 
402 aa  488  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  60.77 
 
 
397 aa  486  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09870  methionine adenosyltransferase  61.06 
 
 
420 aa  486  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00866848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  63.87 
 
 
417 aa  487  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  61.44 
 
 
406 aa  483  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  62.05 
 
 
389 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  62.69 
 
 
396 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  59.54 
 
 
381 aa  481  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  61.31 
 
 
393 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  60.93 
 
 
406 aa  482  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  61.39 
 
 
411 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  61.18 
 
 
406 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4271  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 
406 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268739  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  61.64 
 
 
389 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 
390 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
393 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  60.77 
 
 
388 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  60.45 
 
 
402 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  59.74 
 
 
393 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>