More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1420 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1095    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  49.54 
 
 		 554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  50.18 
 
 		 554 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  48.72 
 
 		 560 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  50.36 
 
 		 554 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  49.08 
 
 		 555 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  49.27 
 
 		 558 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  47.08 
 
 		 555 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  51 
 
 		 553 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  48.45 
 
 		 555 aa  559  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  48.54 
 
 		 555 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  47.55 
 
 		 566 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  50.36 
 
 		 554 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  47.26 
 
 		 555 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  47.45 
 
 		 555 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  48.9 
 
 		 559 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 555 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  47.44 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  47.25 
 
 		 555 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  47.25 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  47.25 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  47.25 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  47.26 
 
 		 558 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  47.25 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  47.25 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.89 
 
 		 555 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  47.07 
 
 		 555 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  47.25 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  47.25 
 
 		 555 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 618 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  46.7 
 
 		 555 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  47.99 
 
 		 551 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  46.9 
 
 		 583 aa  537  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  47.45 
 
 		 556 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.36 
 
 		 557 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  43.88 
 
 		 560 aa  533  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  44.18 
 
 		 557 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  44.18 
 
 		 557 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  44 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  47.26 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.18 
 
 		 557 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  47.08 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  47.08 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  47.08 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  47.08 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  47.08 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  47.08 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  47.08 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  47.08 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  43.61 
 
 		 557 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  44.36 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.64 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.64 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  46.9 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  46.44 
 
 		 593 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  45.44 
 
 		 558 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  46.35 
 
 		 558 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  44.34 
 
 		 551 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 		 556 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  44.16 
 
 		 551 aa  511  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  44.34 
 
 		 551 aa  511  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  46.15 
 
 		 533 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  45.72 
 
 		 631 aa  503  1e-141  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 		 591 aa  503  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  46.27 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  46.45 
 
 		 552 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 		 555 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 		 565 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  45.52 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 		 565 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  45.16 
 
 		 556 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  42.6 
 
 		 560 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  44.71 
 
 		 569 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  44.91 
 
 		 644 aa  489  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  44.65 
 
 		 590 aa  491  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  42.26 
 
 		 548 aa  491  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.67 
 
 		 555 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  44.03 
 
 		 554 aa  487  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  44.38 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  42.78 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  45.72 
 
 		 561 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  40.11 
 
 		 662 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  39.93 
 
 		 662 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  40.62 
 
 		 573 aa  474  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  44.34 
 
 		 561 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  40.11 
 
 		 662 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  44.71 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.22 
 
 		 717 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  43.88 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  41.49 
 
 		 569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  39.19 
 
 		 652 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.06 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  45.54 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  43.96 
 
 		 564 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  44.79 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.02 
 
 		 561 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  43.09 
 
 		 561 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  41.74 
 
 		 556 aa  465  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  39.38 
 
 		 645 aa  465  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>