299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1413 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1413  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  37.82 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  37.93 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  35.43 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  40.21 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  39.5 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  39.83 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  41.3 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  39.42 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 147 aa  67  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11490  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871158  normal  0.911894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  29.52 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  40.66 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1717  ribosome-binding factor A  38.02 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.264807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  29.52 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  29.73 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  37.93 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  31.62 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  31.01 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  34.31 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  29.73 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2748  ribosome-binding factor A  37.89 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131099  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  38.02 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1728  ribosome-binding factor A  27.93 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1513  ribosome-binding factor A  46.23 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.121246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  32.52 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1920  ribosome-binding factor A  34.83 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0348034  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  32.54 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  36.97 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  38 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2427  ribosome-binding factor A  38.04 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224227  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2991  ribosome-binding factor A  38.04 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0708502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  37 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  29.52 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  30.84 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  44 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  34.91 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2560  ribosome-binding factor A  38.04 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  34.38 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  33.66 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  34.41 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>