More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1401 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 187 aa  201  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  50.8 
 
 		 187 aa  201  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  50 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  50 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  55.19 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  54.49 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  50 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3994  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  51.08 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  50.84 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  52.81 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  54.49 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  51.4 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  52.81 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  52.81 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1413  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.889728  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  52.81 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  52.81 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2424  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00108894  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  51.08 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 173 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2554  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  51.08 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>