More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1337 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 
549 aa  1052    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  38.75 
 
 
558 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  35.77 
 
 
558 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.57 
 
 
559 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.75 
 
 
554 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.28 
 
 
563 aa  336  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  40.15 
 
 
559 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  37.43 
 
 
557 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  34.7 
 
 
558 aa  332  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.89 
 
 
561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  37.97 
 
 
562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.89 
 
 
559 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  34.16 
 
 
556 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  35.34 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.59 
 
 
559 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 
561 aa  319  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  40.93 
 
 
557 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  40.93 
 
 
557 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  31.75 
 
 
558 aa  317  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  38.37 
 
 
557 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  36.45 
 
 
599 aa  314  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  34.77 
 
 
560 aa  312  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  37.72 
 
 
552 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.61 
 
 
557 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  33.45 
 
 
565 aa  310  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.84 
 
 
558 aa  309  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.89 
 
 
573 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  31.93 
 
 
564 aa  306  7e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.72 
 
 
561 aa  306  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  32.05 
 
 
558 aa  306  9.000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  39.34 
 
 
556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  34.59 
 
 
560 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.43 
 
 
555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.06 
 
 
568 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  35.29 
 
 
547 aa  300  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  35.42 
 
 
581 aa  297  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  34.46 
 
 
552 aa  295  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.69 
 
 
561 aa  293  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  35.37 
 
 
581 aa  292  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  37.38 
 
 
565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  37.38 
 
 
565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  34.44 
 
 
551 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.49 
 
 
592 aa  286  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  33.64 
 
 
555 aa  284  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  32.39 
 
 
559 aa  280  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.35 
 
 
558 aa  277  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.8 
 
 
525 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.8 
 
 
525 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  39.69 
 
 
560 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  32.69 
 
 
582 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.33 
 
 
584 aa  273  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  32.51 
 
 
560 aa  273  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  33.51 
 
 
549 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.02 
 
 
559 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.81 
 
 
525 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  33.97 
 
 
591 aa  267  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  32.82 
 
 
549 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.63 
 
 
559 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  33.85 
 
 
549 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  31.49 
 
 
571 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.37 
 
 
547 aa  264  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
526 aa  263  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  28.6 
 
 
547 aa  263  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  33.52 
 
 
582 aa  263  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.19 
 
 
525 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  29.54 
 
 
537 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  29.72 
 
 
537 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  32.82 
 
 
549 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  31.86 
 
 
547 aa  259  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  32.82 
 
 
549 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  37.41 
 
 
558 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.38 
 
 
525 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.38 
 
 
525 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.38 
 
 
525 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.13 
 
 
530 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.38 
 
 
525 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.6 
 
 
558 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.68 
 
 
551 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.97 
 
 
557 aa  257  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  34.86 
 
 
544 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  33.81 
 
 
582 aa  256  5e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.38 
 
 
525 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.38 
 
 
525 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  35.88 
 
 
550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  32.31 
 
 
547 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  35.55 
 
 
545 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.99 
 
 
501 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  33.69 
 
 
565 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37 
 
 
525 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  33.58 
 
 
582 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.75 
 
 
525 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  35.95 
 
 
567 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.85 
 
 
525 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.29 
 
 
557 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.34 
 
 
563 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.68 
 
 
527 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  31.16 
 
 
559 aa  250  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.54 
 
 
561 aa  249  8e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.85 
 
 
525 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.9 
 
 
525 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>