More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1300 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  62.01 
 
 		 595 aa  715    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 648 aa  639    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 594 aa  709    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 644 aa  646    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 652 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 662 aa  658    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 639 aa  1288    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 648 aa  637    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 		 595 aa  715    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 647 aa  634  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 643 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 645 aa  629  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 646 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 640 aa  622  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 641 aa  622  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 640 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 649 aa  613  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 638 aa  613  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 644 aa  608  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 659 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 643 aa  611  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 652 aa  610  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 643 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 636 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 647 aa  607  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 644 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 638 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 646 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 644 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 657 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 657 aa  597  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 659 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 645 aa  598  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 645 aa  595  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 637 aa  594  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 657 aa  594  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 648 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 635 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 637 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 		 648 aa  595  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 653 aa  592  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 657 aa  589  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 647 aa  592  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 638 aa  591  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 677 aa  591  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 636 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 604 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 636 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 645 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 649 aa  585  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 640 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 636 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 641 aa  588  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 635 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 640 aa  588  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 639 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 641 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 635 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 643 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 639 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 639 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 637 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 646 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 639 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 639 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 641 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 638 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 644 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 639 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 640 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 648 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 640 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 638 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 636 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 639 aa  581  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 640 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 652 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  45.71 
 
 		 638 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1799  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.96 
 
 		 632 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>