221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1262 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  56.12 
 
 
613 aa  679    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  54.98 
 
 
612 aa  668    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  55.57 
 
 
594 aa  634    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  56.96 
 
 
610 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
599 aa  1202    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  56.67 
 
 
613 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  56.24 
 
 
594 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  49.1 
 
 
612 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  47.58 
 
 
609 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  50 
 
 
623 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  48.91 
 
 
608 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  48.5 
 
 
608 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  43.79 
 
 
606 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  48.49 
 
 
617 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  48.5 
 
 
619 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  48.38 
 
 
625 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  48.75 
 
 
603 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  41.55 
 
 
656 aa  494  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  44.44 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  46.72 
 
 
601 aa  470  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  44.94 
 
 
595 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  46.1 
 
 
602 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  44.69 
 
 
611 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  45.87 
 
 
598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  41.9 
 
 
625 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  43.33 
 
 
605 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  43.38 
 
 
598 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  43.22 
 
 
617 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  41.32 
 
 
894 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0987  glycoside hydrolase 15-related  40.42 
 
 
886 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  42.98 
 
 
596 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  42.05 
 
 
645 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  42.5 
 
 
609 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  44.68 
 
 
617 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  42.64 
 
 
665 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  44.04 
 
 
617 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  40.2 
 
 
887 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  41.98 
 
 
629 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  42.16 
 
 
609 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  42.2 
 
 
636 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  42.03 
 
 
602 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  41.99 
 
 
609 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  41.82 
 
 
609 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  42.81 
 
 
611 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  41.82 
 
 
611 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  40.72 
 
 
679 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  41.82 
 
 
609 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  42.71 
 
 
627 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  43.07 
 
 
586 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  41.38 
 
 
628 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  41.34 
 
 
850 aa  419  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  41.82 
 
 
609 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  42.88 
 
 
599 aa  422  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  41.99 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  42.5 
 
 
616 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  41.99 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  41.24 
 
 
627 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  43.66 
 
 
621 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  41.95 
 
 
601 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  42.03 
 
 
597 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  41.99 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  41.99 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  41.99 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  41.99 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  41.99 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  43 
 
 
596 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  42.79 
 
 
600 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  43.24 
 
 
602 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  42.91 
 
 
600 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  41.71 
 
 
626 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  41.74 
 
 
613 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  41.1 
 
 
619 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  39.29 
 
 
601 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  40.86 
 
 
620 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  41.1 
 
 
619 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  41.98 
 
 
629 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  43.07 
 
 
602 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  40.51 
 
 
672 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  41.89 
 
 
626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  41.61 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  40.35 
 
 
668 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  40.26 
 
 
642 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  39.46 
 
 
629 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  41.05 
 
 
619 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  40.57 
 
 
608 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  40.2 
 
 
623 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  39.55 
 
 
677 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  39.55 
 
 
677 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  41.83 
 
 
636 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  40.36 
 
 
621 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  40.93 
 
 
868 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  41.37 
 
 
602 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  40.86 
 
 
610 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  39.55 
 
 
677 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  39.6 
 
 
602 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  41.68 
 
 
635 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  42.44 
 
 
639 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  39.8 
 
 
594 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  38.93 
 
 
612 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 
623 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>