More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1238 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
340 aa  671    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  54.65 
 
 
353 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  44.67 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  42.57 
 
 
340 aa  255  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  38.71 
 
 
749 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  47.77 
 
 
347 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 
271 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
228 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
228 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
229 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
228 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
229 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  38.97 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
253 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1024  glycosyl transferase family 2  41.81 
 
 
268 aa  133  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.708512  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 
226 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
232 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
229 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
237 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 
448 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  39.05 
 
 
225 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  37.68 
 
 
253 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
226 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
242 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  43.46 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  43.32 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
243 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
242 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
242 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
230 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
230 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 
321 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
230 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.17 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
242 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
229 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
227 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
227 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  41.55 
 
 
237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
230 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  32.23 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  37.05 
 
 
233 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
293 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
285 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 
252 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
243 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  29.57 
 
 
234 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
303 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
327 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
321 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 
249 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 
220 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  37.33 
 
 
220 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
336 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
226 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
241 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.89 
 
 
238 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
450 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  37.96 
 
 
245 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
230 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
385 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  29.71 
 
 
245 aa  103  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  37.56 
 
 
250 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
411 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
336 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.68 
 
 
239 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
230 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
227 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 
227 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
346 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
291 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
230 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
235 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
305 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
236 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32.31 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
246 aa  99.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
250 aa  99.8  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32 
 
 
382 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 
227 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  38.22 
 
 
263 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  37.74 
 
 
410 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.77 
 
 
248 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
220 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
333 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.55 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  37.27 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.62 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
295 aa  96.7  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
227 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
246 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>