More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1228 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
138 aa  274  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  42.42 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  44.85 
 
 
154 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  43.07 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  46.97 
 
 
151 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  46.97 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  45.32 
 
 
155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  46.97 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  46.97 
 
 
151 aa  116  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  45.32 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  45.32 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  46.21 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  49.24 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  46.21 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  44.6 
 
 
149 aa  114  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  42.45 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  42.42 
 
 
146 aa  110  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  39.39 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  49.24 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  42.86 
 
 
143 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  38.24 
 
 
143 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  41.35 
 
 
143 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  37.31 
 
 
154 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 
159 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  38.69 
 
 
155 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  33.09 
 
 
155 aa  102  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  36.76 
 
 
155 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  41.35 
 
 
143 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  39.1 
 
 
153 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  38.64 
 
 
150 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
142 aa  100  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  39.85 
 
 
143 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 
152 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  38.17 
 
 
137 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  34.07 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  37.31 
 
 
157 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  37.31 
 
 
157 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  37.31 
 
 
157 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  37.78 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  43.61 
 
 
150 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  42.11 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  39.37 
 
 
136 aa  97.1  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  37.78 
 
 
152 aa  97.1  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  43.61 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  35.61 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  40.3 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  38.35 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  39.42 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  39.37 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  38.52 
 
 
157 aa  94.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
142 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  33.08 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  33.08 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  33.08 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  33.08 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  33.08 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  33.08 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  38.76 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  39.42 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  37.7 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  35.43 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  36.03 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  37.04 
 
 
151 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  37.12 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 
151 aa  90.1  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  36.8 
 
 
139 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 
152 aa  90.1  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.23 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  35.88 
 
 
147 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  36.09 
 
 
167 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  36.36 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 
167 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 
167 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  37.8 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  38.62 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
150 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 
142 aa  87.4  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 
150 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 
139 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 
151 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  33.83 
 
 
143 aa  87  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>