More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1166 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  100 
 
 		 572 aa  1122    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  50.54 
 
 		 553 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  48.65 
 
 		 556 aa  529  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  46.96 
 
 		 558 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  50.36 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  50 
 
 		 557 aa  512  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  49.64 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  44.84 
 
 		 561 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  43.9 
 
 		 558 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  45.79 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  48.04 
 
 		 563 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  47.93 
 
 		 553 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  43.85 
 
 		 568 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.65 
 
 		 553 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  43.95 
 
 		 568 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.09 
 
 		 871 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.83 
 
 		 563 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.05 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.27 
 
 		 568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.88 
 
 		 568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  43.52 
 
 		 577 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  44.36 
 
 		 568 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  45.36 
 
 		 564 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.19 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.47 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.19 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.83 
 
 		 568 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.31 
 
 		 571 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.42 
 
 		 568 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  42.78 
 
 		 885 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.48 
 
 		 573 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.86 
 
 		 571 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  40.21 
 
 		 787 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.22 
 
 		 568 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 553 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  43.34 
 
 		 888 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  44.36 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  45.75 
 
 		 559 aa  452  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  41 
 
 		 567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.93 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.19 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  45.08 
 
 		 575 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.31 
 
 		 564 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  43.46 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.64 
 
 		 570 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.31 
 
 		 570 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  47.2 
 
 		 520 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  41.52 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  42.02 
 
 		 891 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  43.74 
 
 		 603 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.35 
 
 		 599 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  48.63 
 
 		 520 aa  435  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  43.11 
 
 		 573 aa  435  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  48.44 
 
 		 520 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.58 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  40.89 
 
 		 577 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  42.86 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  43.01 
 
 		 599 aa  429  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  43.36 
 
 		 599 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  43.83 
 
 		 569 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  47.37 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  43.49 
 
 		 591 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  42.19 
 
 		 637 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.27 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.68 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.52 
 
 		 565 aa  428  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  44.95 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  44.77 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.74 
 
 		 568 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.94 
 
 		 562 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.04 
 
 		 569 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.86 
 
 		 569 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.75 
 
 		 569 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  40.71 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  39.47 
 
 		 563 aa  420  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  45.95 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  47.08 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.58 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.89 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 580 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  41.8 
 
 		 577 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.32 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  41.53 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  41.58 
 
 		 570 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  37.83 
 
 		 562 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.5 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  40.14 
 
 		 806 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  42.42 
 
 		 571 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  41.35 
 
 		 612 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  40.89 
 
 		 585 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  41.24 
 
 		 557 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  40.54 
 
 		 577 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.15 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.14 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.86 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.75 
 
 		 568 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  42.17 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.71 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>