171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1151 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 338 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  34.55 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  30.09 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  29.09 
 
 		 328 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  30.66 
 
 		 843 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  31.75 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  28.95 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  29.38 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  28.65 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 367 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  29.69 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  31.45 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 328 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  31.96 
 
 		 355 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  28.75 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 329 aa  89.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  31.86 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 407 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.32 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  31.1 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  27.65 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  41.27 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  39.68 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  27.62 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  30.6 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  28.42 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  36.08 
 
 		 543 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  43.48 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  23.53 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  27.15 
 
 		 352 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  40.51 
 
 		 523 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  36.23 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  53.57 
 
 		 462 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  50.85 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  54.55 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  47.14 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  50 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  53.7 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  47.46 
 
 		 433 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  31.82 
 
 		 484 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  47.17 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  50.85 
 
 		 463 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  55.77 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  46.43 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  43.28 
 
 		 476 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  23.03 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  43.86 
 
 		 460 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  33.56 
 
 		 456 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  35.71 
 
 		 457 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  52.63 
 
 		 492 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 		 530 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 		 530 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 		 530 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  47.27 
 
 		 465 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  30.99 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  34.94 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  43.86 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  50.91 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  49.02 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  45.31 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  45.9 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  45.76 
 
 		 463 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  38.89 
 
 		 499 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  31.03 
 
 		 516 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  25.27 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  42.59 
 
 		 505 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 		 580 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  47.17 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  42.37 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  43.28 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  44.83 
 
 		 503 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  39.8 
 
 		 512 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  39.8 
 
 		 512 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  40.62 
 
 		 469 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  44.83 
 
 		 421 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>