70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1137 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  54.04 
 
 
218 aa  218  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  63.57 
 
 
215 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  63.12 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  58.16 
 
 
267 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  54.17 
 
 
195 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  46.48 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  51.4 
 
 
270 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  43.7 
 
 
207 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  25.43 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  34.81 
 
 
268 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  26.2 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  32.14 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  32.58 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  33.33 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  36.07 
 
 
339 aa  56.6  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.55 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  31.43 
 
 
327 aa  56.2  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  34.45 
 
 
365 aa  55.8  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  38.21 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  33.33 
 
 
291 aa  55.5  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.82 
 
 
270 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  34.21 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  35.19 
 
 
187 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  30.88 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  33.58 
 
 
381 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  28.83 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  36.67 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  33.33 
 
 
384 aa  50.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  31.62 
 
 
377 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  34.09 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  33.04 
 
 
286 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  34.87 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  37.5 
 
 
262 aa  48.9  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  27.47 
 
 
305 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  32.59 
 
 
377 aa  48.5  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  26.12 
 
 
324 aa  48.5  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  32.12 
 
 
238 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  27.92 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  37.29 
 
 
323 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  27.38 
 
 
293 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  32.85 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  38.24 
 
 
269 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30.15 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  35.4 
 
 
412 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  29.79 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  30.15 
 
 
272 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  33.06 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  30.15 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  35.19 
 
 
282 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  35.19 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  25.69 
 
 
316 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  29.66 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  29.93 
 
 
291 aa  45.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  31.62 
 
 
268 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  30.89 
 
 
294 aa  45.4  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  32.12 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  27.78 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  30.77 
 
 
395 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  36.21 
 
 
308 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  32.58 
 
 
250 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  37.04 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  28.57 
 
 
316 aa  42.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  36 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  35 
 
 
350 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  20.74 
 
 
206 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  20.74 
 
 
206 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  30.66 
 
 
266 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  35.51 
 
 
251 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.58 
 
 
336 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>