224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1071 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  598  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  53 
 
 
334 aa  285  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  54.42 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  52.23 
 
 
303 aa  254  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  51.34 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  47.57 
 
 
291 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  50 
 
 
303 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  50 
 
 
303 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  50 
 
 
303 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  50.34 
 
 
283 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  47.55 
 
 
286 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  45.99 
 
 
286 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  45.99 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  46.62 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  44.7 
 
 
324 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  44.7 
 
 
324 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  43.71 
 
 
285 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  40.07 
 
 
283 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  40.07 
 
 
283 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  40.07 
 
 
283 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  42.66 
 
 
285 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  46.52 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  43.15 
 
 
288 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  40.67 
 
 
287 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  40.67 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  42.4 
 
 
294 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.87 
 
 
280 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  43.68 
 
 
301 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  43.44 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  43.44 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  42.96 
 
 
279 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  41.95 
 
 
281 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  43.03 
 
 
276 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  42.45 
 
 
285 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  44.4 
 
 
288 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  41.53 
 
 
272 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  42.8 
 
 
281 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  41.95 
 
 
301 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  36.14 
 
 
275 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  36.11 
 
 
271 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  31.56 
 
 
346 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  31.13 
 
 
335 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
327 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.36 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.64 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.47 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  24.28 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.41 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.6 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.46 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.57 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.82 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.26 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  32.32 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  30.92 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  33.15 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  33 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.9 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.11 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.6 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  31.6 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.32 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 
372 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  27.86 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  27.86 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.4 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.52 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  27.74 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  27.33 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  29.1 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.92 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.1 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.1 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  33.33 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  27.34 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  27.06 
 
 
321 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.39 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.39 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  28.09 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  29.67 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  25.9 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  27.15 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  28.57 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.58 
 
 
346 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
361 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  27.8 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  26.38 
 
 
343 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.1 
 
 
325 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  27.59 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  26.98 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  26.43 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>