37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1053 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  391  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  63.49 
 
 
195 aa  220  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  51.01 
 
 
649 aa  155  5e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  46.88 
 
 
310 aa  154  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  47.26 
 
 
310 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  46.58 
 
 
310 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  46.9 
 
 
443 aa  146  2e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  44.24 
 
 
268 aa  146  2e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  42.51 
 
 
270 aa  145  4e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  45.89 
 
 
310 aa  144  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  42.42 
 
 
269 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  45.27 
 
 
270 aa  142  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  46.3 
 
 
277 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  44.51 
 
 
269 aa  140  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  47.55 
 
 
288 aa  139  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  44.44 
 
 
294 aa  137  8e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  44.44 
 
 
294 aa  137  8e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  45.95 
 
 
293 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  46.48 
 
 
540 aa  136  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  45.27 
 
 
291 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  48.55 
 
 
270 aa  130  2e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  42.86 
 
 
268 aa  128  5e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  47.3 
 
 
294 aa  127  7e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  42.77 
 
 
456 aa  127  1e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  39.86 
 
 
559 aa  125  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  39.87 
 
 
265 aa  121  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  47.45 
 
 
446 aa  119  4e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  32.39 
 
 
265 aa  89.4  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0224  protein of unknown function DUF147  38.67 
 
 
267 aa  49.3  4e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.24846e-09  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13513  putative transmembrane protein  38.24 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3055  protein of unknown function DUF147  35.16 
 
 
382 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0416862  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  32.94 
 
 
258 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  28.97 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2337  protein of unknown function DUF147  35.56 
 
 
276 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2024  hypothetical protein  31.25 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0837  protein of unknown function DUF147  47.27 
 
 
275 aa  41.6  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0146  protein of unknown function DUF147  34.72 
 
 
269 aa  41.2  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>