More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0992 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 435 aa  860    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  54.88 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  54.88 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  53.61 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  56.02 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  54.06 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  53.26 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  53.85 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  53.26 
 
 		 431 aa  455  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  51.75 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  53.04 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  51.4 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  52.09 
 
 		 431 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  56.31 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  54.78 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 451 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  51.5 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  52.8 
 
 		 430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  54.78 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  52.91 
 
 		 431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  51.05 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  53.02 
 
 		 431 aa  441  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  51.74 
 
 		 431 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  53.92 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  48.83 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  49.18 
 
 		 451 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  51.75 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  52.68 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  47.54 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  51.4 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  52.21 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  48.48 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  54.08 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  51.98 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 		 431 aa  438  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  47.21 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  48.36 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  52.21 
 
 		 437 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  48.36 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  48.36 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  52.68 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  46.74 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  51.52 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  48.48 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  46.98 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  47.66 
 
 		 431 aa  425  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  46.98 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0818  adenylosuccinate lyase  53.7 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  48.02 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  51.05 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  48.77 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  47.79 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  49.18 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  48.14 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  46.94 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  48.14 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  47.39 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  48.3 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  45.92 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  46.94 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  49.76 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  46.39 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  50.81 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  46.39 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  52.52 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 432 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  49.42 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  47.09 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  45.35 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  46.36 
 
 		 442 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  46.14 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  48.33 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  46.36 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>