More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0949 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  100 
 
 		 301 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  54.36 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  51.35 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  45.39 
 
 		 310 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  46.36 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  44 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  50.69 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  45.73 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  44.33 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  43.48 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.2 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  43.69 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  37.12 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  37.12 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  38.18 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  38.85 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  43.62 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  44.13 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  43.62 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  52.38 
 
 		 283 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  43.62 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  43.62 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  38.87 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  43 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  43.62 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  43.62 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  39.27 
 
 		 345 aa  195  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  43.62 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  43.92 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  42.66 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  43.29 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  45.58 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  42.28 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.8 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  43 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  41.28 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  40 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  41.64 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  41.84 
 
 		 308 aa  191  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  42.14 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  40 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  40 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  42.14 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  42.14 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  43.1 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  42.14 
 
 		 309 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  42.14 
 
 		 309 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  37.09 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  41.36 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.37 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  42.32 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  44.22 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.13 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.21 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  36.82 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  36.18 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  35.64 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  42.23 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.6 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  43.48 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  44.22 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  43.73 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.8 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  33.56 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.59 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  41.5 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33.9 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.93 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.79 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  39.53 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  43.14 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  43.69 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  43.14 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  42.81 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  40.82 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  35.2 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  42.96 
 
 		 314 aa  181  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  41.53 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  40.67 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39.31 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  36.3 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  36.3 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  36.3 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  36.3 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  36.3 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  39.8 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  40.53 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  42.12 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  36.45 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  43.2 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  44.81 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  43.61 
 
 		 349 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  39.2 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  41.78 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.94 
 
 		 297 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  44 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  39.19 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  42.47 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  43.54 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>