37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0932 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1053    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  48.57 
 
 
531 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1241  hypothetical protein  51.84 
 
 
521 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  29.54 
 
 
652 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  27.45 
 
 
621 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  27.66 
 
 
624 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  27.43 
 
 
619 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  27.95 
 
 
619 aa  96.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  37.37 
 
 
880 aa  92.8  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  33 
 
 
1009 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  28.3 
 
 
623 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  30.42 
 
 
881 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  33.9 
 
 
1245 aa  85.1  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0195  hypothetical protein  33.19 
 
 
522 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  23.54 
 
 
880 aa  81.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  36 
 
 
881 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  32.17 
 
 
984 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  26.28 
 
 
619 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  31.16 
 
 
882 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  31.63 
 
 
1001 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  36.32 
 
 
580 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  34.74 
 
 
880 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  33.07 
 
 
613 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0095  hypothetical protein  28.51 
 
 
514 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  22.91 
 
 
875 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  30.41 
 
 
1076 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  28.76 
 
 
991 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  30.69 
 
 
1099 aa  67.8  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  33.99 
 
 
947 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  27.75 
 
 
993 aa  64.3  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  32.14 
 
 
634 aa  63.5  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  26.56 
 
 
1005 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  27.54 
 
 
989 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  27.75 
 
 
1103 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  27.27 
 
 
1109 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  27.66 
 
 
1093 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  29.23 
 
 
455 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>