More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0895 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
331 aa  675    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.99 
 
 
340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  49.85 
 
 
325 aa  325  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
319 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.66 
 
 
323 aa  324  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.47 
 
 
321 aa  322  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
319 aa  322  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
316 aa  322  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
317 aa  322  6e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
316 aa  319  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.38 
 
 
325 aa  319  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
325 aa  318  6e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.47 
 
 
321 aa  318  7.999999999999999e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.31 
 
 
326 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
325 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
315 aa  315  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
319 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.23 
 
 
325 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.23 
 
 
326 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.46 
 
 
326 aa  311  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.91 
 
 
322 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.6 
 
 
322 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 
313 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
316 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.46 
 
 
326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.42 
 
 
316 aa  309  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 
309 aa  309  5e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.78 
 
 
316 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.58 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.32 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.23 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.12 
 
 
326 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 
322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
319 aa  305  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.46 
 
 
326 aa  305  9.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
309 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.59 
 
 
322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.54 
 
 
309 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.92 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.54 
 
 
326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 
314 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  46.84 
 
 
317 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.41 
 
 
315 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.06 
 
 
326 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.69 
 
 
327 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  47.6 
 
 
327 aa  300  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.22 
 
 
347 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.9 
 
 
309 aa  300  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
318 aa  298  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.85 
 
 
324 aa  298  8e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.48 
 
 
327 aa  298  9e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.05 
 
 
308 aa  297  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_377  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.54 
 
 
324 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
314 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.16 
 
 
324 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.02 
 
 
359 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.4 
 
 
327 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 
315 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0435  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.23 
 
 
324 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.187137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 
314 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.9 
 
 
326 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.1 
 
 
315 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.1 
 
 
315 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
317 aa  295  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
316 aa  295  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  47.45 
 
 
312 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.01 
 
 
312 aa  294  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.48 
 
 
327 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
326 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.2 
 
 
323 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.38 
 
 
309 aa  293  3e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.25 
 
 
311 aa  293  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.39 
 
 
321 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
326 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
326 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.4 
 
 
314 aa  292  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
326 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.28 
 
 
326 aa  292  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2708  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.04 
 
 
327 aa  291  7e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.77 
 
 
326 aa  291  7e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1015  ribose-phosphate diphosphokinase  47.15 
 
 
344 aa  291  8e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.91 
 
 
323 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.84 
 
 
317 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.95 
 
 
324 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>