296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0844 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  100 
 
 		 313 aa  621  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  47.1 
 
 		 279 aa  215  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  40.07 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  38.73 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  37.23 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  36.75 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  44.68 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  44.13 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  44.13 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  41.81 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  35.48 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  37.37 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  40.86 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  40.86 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  37.5 
 
 		 310 aa  186  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  39.78 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  37.14 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  42.05 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  40.13 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  39.47 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  37.85 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  37.41 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  37.86 
 
 		 324 aa  178  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  42.47 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  41.58 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  40.52 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  40.92 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  39.6 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  41.69 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  39.64 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  39.71 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  38.04 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  43.07 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  40.15 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  35.48 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  39.18 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  38.38 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  35.61 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  38.71 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  42.19 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  38.57 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  38.62 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  38.62 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  38.62 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  35.13 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  38.43 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  38.72 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  40.07 
 
 		 315 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  35.59 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  33.33 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  32.97 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  32.97 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  33.33 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  35.51 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  37.63 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  35.46 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  36.22 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  37.92 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  37.78 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  34.47 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  35.29 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  33.57 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  33.58 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  36.84 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.33 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  32.71 
 
 		 575 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.96 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  31.01 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  35.02 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  37.55 
 
 		 353 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  34.08 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  32.21 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  35.23 
 
 		 505 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  31.09 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  32.83 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  36.62 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.83 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  35.09 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  28.32 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  35.87 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  35.96 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  35.14 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.45 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  34.8 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  32.58 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  36.86 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  34.46 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  30.94 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  34.08 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  34.59 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  34.98 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  29.48 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  31.44 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  36.46 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  34.74 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  31.2 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  35.84 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.58 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>