More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0833 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
498 aa  988    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  63.45 
 
 
501 aa  611  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  61.29 
 
 
498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  55.94 
 
 
493 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  55.94 
 
 
493 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  55.94 
 
 
493 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  56.88 
 
 
489 aa  527  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  55.94 
 
 
506 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  53.68 
 
 
505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  54.55 
 
 
510 aa  495  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  52.97 
 
 
495 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  51.1 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  48.36 
 
 
495 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3313  carbohydrate kinase, FGGY  43.54 
 
 
503 aa  356  5e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  35.83 
 
 
506 aa  293  4e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  35.48 
 
 
506 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  38.51 
 
 
509 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  33.14 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  31.79 
 
 
511 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  37.82 
 
 
548 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  32.95 
 
 
512 aa  263  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  30.41 
 
 
512 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.04 
 
 
501 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  36.18 
 
 
501 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  34.26 
 
 
538 aa  250  5e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.36 
 
 
500 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  33.46 
 
 
508 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  33.84 
 
 
518 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  31.62 
 
 
503 aa  248  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.57 
 
 
492 aa  246  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.57 
 
 
492 aa  246  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  35.21 
 
 
524 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  33.4 
 
 
514 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  34.91 
 
 
515 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.52 
 
 
496 aa  240  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  32.75 
 
 
514 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  33.6 
 
 
497 aa  239  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  36.11 
 
 
511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  34.43 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  34.43 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  34.43 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  38.32 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.24 
 
 
504 aa  232  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  37.11 
 
 
512 aa  230  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  33.72 
 
 
515 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  34.64 
 
 
493 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  33.85 
 
 
515 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.47 
 
 
506 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.95 
 
 
509 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.87 
 
 
498 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  33.46 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  34.22 
 
 
505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  32.87 
 
 
499 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  29.4 
 
 
497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.87 
 
 
512 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.65 
 
 
502 aa  217  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  32.95 
 
 
520 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25.69 
 
 
506 aa  216  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.96 
 
 
511 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  32.15 
 
 
502 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.77 
 
 
509 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  33.66 
 
 
514 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  33.27 
 
 
494 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  33.27 
 
 
494 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  33.78 
 
 
513 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  33.78 
 
 
513 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  33.78 
 
 
513 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  33.78 
 
 
513 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  33.78 
 
 
513 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  33.78 
 
 
513 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  33.47 
 
 
494 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  33.78 
 
 
513 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.07 
 
 
490 aa  203  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  30.29 
 
 
530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  33.67 
 
 
499 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  34.93 
 
 
438 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  29.55 
 
 
514 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  32.66 
 
 
510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  31.54 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  28.07 
 
 
512 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  28.63 
 
 
512 aa  193  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  33.07 
 
 
505 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.17 
 
 
489 aa  191  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  27.59 
 
 
512 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  30.46 
 
 
501 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  29.84 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  35.21 
 
 
472 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  28.65 
 
 
512 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  28.05 
 
 
513 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.05 
 
 
513 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  28.05 
 
 
513 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  28.05 
 
 
513 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  31.9 
 
 
482 aa  187  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  27.66 
 
 
513 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.55 
 
 
488 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  27.85 
 
 
513 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.92 
 
 
483 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.92 
 
 
483 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.59 
 
 
505 aa  186  9e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  35.25 
 
 
472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>