More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0831 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  100 
 
 
326 aa  641    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  63.5 
 
 
336 aa  401  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  42.69 
 
 
347 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  40.48 
 
 
342 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  42.2 
 
 
334 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  41.34 
 
 
348 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  45.63 
 
 
331 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  41.1 
 
 
332 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  44.21 
 
 
346 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  43.69 
 
 
346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.85 
 
 
330 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37 
 
 
336 aa  232  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 
335 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  41.74 
 
 
342 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  41.77 
 
 
357 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  43.87 
 
 
348 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.88 
 
 
338 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  41.34 
 
 
333 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.29 
 
 
330 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  40.31 
 
 
329 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  40.18 
 
 
353 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.33 
 
 
352 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  41.16 
 
 
349 aa  222  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  40.62 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 
339 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  41.21 
 
 
331 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.2 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.65 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.48 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  40.24 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  39.8 
 
 
346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  39.47 
 
 
346 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  42.47 
 
 
337 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  39.29 
 
 
336 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 
355 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 
340 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  43.27 
 
 
358 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  40.77 
 
 
333 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  35.91 
 
 
323 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  35.6 
 
 
323 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.84 
 
 
331 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  35.6 
 
 
323 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  35.6 
 
 
323 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  34.17 
 
 
344 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  35.6 
 
 
323 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  37.27 
 
 
332 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  35.6 
 
 
323 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  36.96 
 
 
323 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  40.26 
 
 
343 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  35.29 
 
 
323 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  35.29 
 
 
323 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  39.14 
 
 
337 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  40 
 
 
341 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  39.02 
 
 
337 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.88 
 
 
339 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  32.48 
 
 
338 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  34.98 
 
 
323 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  40.85 
 
 
328 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 
332 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.94 
 
 
341 aa  202  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  38.78 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.03 
 
 
332 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  39.46 
 
 
353 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  38.64 
 
 
340 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.58 
 
 
341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  38.96 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.82 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  37.82 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  38.67 
 
 
333 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  32.72 
 
 
332 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  38.07 
 
 
361 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 
340 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 
347 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  39.39 
 
 
353 aa  198  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.58 
 
 
337 aa  198  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0609  alanine racemase  41.67 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  38.31 
 
 
340 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  38.06 
 
 
338 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 
333 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.08 
 
 
333 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.88 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  38.02 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  37.66 
 
 
343 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  37.82 
 
 
337 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  35.45 
 
 
349 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.94 
 
 
332 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.94 
 
 
332 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1696  transcriptional regulator, LacI family  37.99 
 
 
342 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 
332 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.94 
 
 
332 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 
339 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.64 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.64 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.33 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>