87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0824 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  100 
 
 
200 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  41.58 
 
 
235 aa  135  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  38.69 
 
 
218 aa  130  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  41.58 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  43.04 
 
 
232 aa  121  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  38.81 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  42.62 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  37.81 
 
 
236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  36.14 
 
 
233 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  38.12 
 
 
235 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  45.13 
 
 
129 aa  104  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  37.7 
 
 
260 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  35.76 
 
 
237 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  35.12 
 
 
227 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  32.41 
 
 
217 aa  97.1  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  33.33 
 
 
219 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  33.33 
 
 
219 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  30.86 
 
 
219 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  33.33 
 
 
219 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  33.33 
 
 
219 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  30.63 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  35.75 
 
 
214 aa  91.3  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  29.46 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  31.78 
 
 
230 aa  88.6  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  40.14 
 
 
249 aa  85.9  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  32.24 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  30.77 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  33.93 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  33.82 
 
 
338 aa  79  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  31.4 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  33.13 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  37.4 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  38.96 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  32.26 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  37.98 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  32.19 
 
 
264 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  31.49 
 
 
215 aa  55.1  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  35.29 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  32.7 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  42.64 
 
 
219 aa  51.2  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  32.58 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  34.85 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46702  predicted protein  35.1 
 
 
337 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761256  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  36.3 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
266 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  47.5 
 
 
417 aa  48.9  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  40.31 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.9 
 
 
268 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  27.33 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  38.16 
 
 
219 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  32.7 
 
 
217 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  36.52 
 
 
243 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38064  predicted protein  31.62 
 
 
283 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00684271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  30.6 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  35.61 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10134  glucose-inducible SAM-dependent methyltransferase Rrg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16310)  34.62 
 
 
354 aa  45.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  32.58 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  34.07 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
262 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  31.34 
 
 
223 aa  44.7  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28521  predicted protein  28.68 
 
 
229 aa  44.7  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17089  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.55 
 
 
278 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.19 
 
 
233 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  32.32 
 
 
566 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04541  nicotinamide N-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17750)  29.71 
 
 
350 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.969056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.96 
 
 
234 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  30.83 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  25.38 
 
 
244 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  29.85 
 
 
218 aa  42.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  23.36 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  31.34 
 
 
214 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  35.09 
 
 
243 aa  42  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  33.99 
 
 
220 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28790  predicted protein  53.85 
 
 
528 aa  41.6  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  34.21 
 
 
220 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.78 
 
 
268 aa  41.2  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3434  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
286 aa  41.2  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  35.61 
 
 
219 aa  41.2  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.02 
 
 
236 aa  41.2  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  37 
 
 
241 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  32.89 
 
 
312 aa  41.2  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>