More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0814 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  63.52 
 
 		 544 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  62.41 
 
 		 544 aa  671    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  60.8 
 
 		 539 aa  644    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 544 aa  655    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.59 
 
 		 542 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  62.59 
 
 		 540 aa  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  66.04 
 
 		 544 aa  689    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  66.23 
 
 		 544 aa  691    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  66.23 
 
 		 544 aa  691    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  61.92 
 
 		 544 aa  660    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  63.04 
 
 		 549 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  61.61 
 
 		 545 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  67.41 
 
 		 541 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  65.51 
 
 		 537 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  62.33 
 
 		 541 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  61.41 
 
 		 540 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  61.18 
 
 		 542 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  61.31 
 
 		 548 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  59.23 
 
 		 542 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  59.47 
 
 		 554 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  68.45 
 
 		 545 aa  701    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 550 aa  668    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  68.4 
 
 		 542 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  65.28 
 
 		 542 aa  671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  63.12 
 
 		 546 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  62.2 
 
 		 548 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  66.04 
 
 		 544 aa  689    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 549 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  60.9 
 
 		 555 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 552 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  61.62 
 
 		 543 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 548 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  64.19 
 
 		 539 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  65.33 
 
 		 536 aa  681    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  61.77 
 
 		 547 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  64.3 
 
 		 539 aa  687    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  63.47 
 
 		 538 aa  677    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  65.17 
 
 		 547 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  61.85 
 
 		 543 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  65.97 
 
 		 541 aa  679    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  68.91 
 
 		 540 aa  715    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  61.12 
 
 		 550 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  65.72 
 
 		 549 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  66.79 
 
 		 540 aa  685    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  62.8 
 
 		 544 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  65.47 
 
 		 544 aa  689    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  62.13 
 
 		 542 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  68.41 
 
 		 541 aa  731    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  66.42 
 
 		 542 aa  692    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  65.39 
 
 		 547 aa  669    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  61.87 
 
 		 550 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  66.86 
 
 		 542 aa  675    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  62.73 
 
 		 553 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  63.4 
 
 		 545 aa  669    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  61.61 
 
 		 547 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  62.41 
 
 		 547 aa  640    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 539 aa  641    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  60.74 
 
 		 538 aa  657    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  66.42 
 
 		 541 aa  695    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  100 
 
 		 540 aa  1063    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  66.79 
 
 		 538 aa  716    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0610  chaperonin GroEL  65.35 
 
 		 546 aa  671    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.912876  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  62.27 
 
 		 542 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  60.74 
 
 		 538 aa  657    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  63.13 
 
 		 539 aa  678    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 539 aa  676    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  66.79 
 
 		 538 aa  716    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  64.42 
 
 		 540 aa  664    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  63.71 
 
 		 546 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  64.42 
 
 		 547 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  69.1 
 
 		 540 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  64.94 
 
 		 541 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  67.23 
 
 		 542 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  60.59 
 
 		 542 aa  640    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  58.26 
 
 		 541 aa  644    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  61.15 
 
 		 543 aa  654    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  61.41 
 
 		 539 aa  657    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 539 aa  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  66.92 
 
 		 545 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  63.57 
 
 		 536 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  66.42 
 
 		 541 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  67.94 
 
 		 540 aa  699    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 543 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 542 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  62.92 
 
 		 551 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  70.97 
 
 		 539 aa  735    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  64.83 
 
 		 541 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 554 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  60.94 
 
 		 547 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 546 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  62.83 
 
 		 540 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  66.6 
 
 		 541 aa  691    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  67.29 
 
 		 541 aa  706    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  66.42 
 
 		 541 aa  695    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  65.56 
 
 		 541 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  62.08 
 
 		 547 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 547 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4150  chaperonin GroEL  62.74 
 
 		 548 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00153421  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  68 
 
 		 541 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  68.13 
 
 		 540 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>